个体的生理结构与心理结构是相互联系、彼此影响的。大量的科学研究证实，音乐能影响个体的情绪，而个体的情绪则对个体生理因素变化产生影响。例如当个体处在旋律优美的音乐环境之中，个体的情绪得到舒缓、安定，个体心理的平静和稳定有助于改善神经系统、心血管系统、内分泌系统和消化系统的功能，促使人体分泌一种有利于身体健康的活性物质，可以调节体内血管的流量和神经传导。

　　从生理角度上说，音乐声波的频率和声压会引起生理上的反应。音乐的频率、节奏和有规律的声波振动，是一种物理能量，而适度的物理能量会引起人体组织细胞发生和谐共振现象，能使颅腔、胸腔或某一个组织产生共振，这种声波引起的共振现象，会直接影响人的脑电波、心率、呼吸节奏等；从心理角度上说，音乐声波的频率和声压会引起心理上的反应。良性的音乐能提高大脑皮层的兴奋性，可以改善人们的情绪，激发人们的感情，振奋人们的精神。同时有助于消除心理、社会因素所造成的紧张、焦虑、忧郁、恐怖等不良心理状态，提高应激能力。

　　音乐疗法在学校心理健康教育的各个环节都能起到极大的促进作用，如对于预防和治疗学生的身心疾病，调节学生的不良情绪，培养学生的健康情感和协作精神，促进学生的自我表达，开发学生的创新思维和创新能力等都是具有非常重要的作用。